Bogdan Lobont nasce a Hunedoara (Romania) il 18 gennaio 1978. I primi passi nel mondo del calcio li muove nel 1991 nel Carvin Hunedoara, squadra della sua città, dove resterà fino al 1997 prima del salto di categoria al Rapid Bucarest. Qui resta per 3 anni prima di venire notato dall’Ajax.
Lobont si trasferisce così in Olanda, ma l’anno successivo viene ceduto alla Dinamo Bucarest dove resta per un anno prima di tornare nuovamente all’Ajax. Ad Amsterdam resta per altri 4 anni, fino al 2006 poi accetta la chiamata della Fiorentina, che cercava un sostituto dell’infortunato Frey. L’anno successivo, con il rientro di Frey, trova meno spazio nel club viola e viene ceduto alla Dinamo Bucarest nel gennaio del 2007. In Romania resta fino al 2009, poi in accordo col club romeno, in seguito ad un infortunio, viene curato a Trigoria dallo staff della Roma.
I giallorossi lo prendono in prestito con diritto di riscatto fissato a 1.8 milioni di euro il 31 agosto 2009. Il debutto in giallorosso è il 4 ottobre 2009 in Roma – Napoli, terminata 2-1 per i giallorossi nonostante un suo grave errore sul gol di Lavezzi. A Roma non trova molto spazio come titolare, spesso relegato in panchina o come terzo portiere, nonostante i vari cambi di allenatore nel corso degli anni. Il 1° luglio 2013 ha rinnovato con la Roma fino al 2016. Non viene mai impiegato e nel luglio 2016 rinnova per altri 2 anni con la Roma.
Si ritira nel 2018.
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